檢查精子畸形率需要多久，主要取決于檢查精子畸形率的方法，不同方法所需要的時間也有所不同，常見的檢查精子畸形率的方法主要包括手淫法、顯微鏡檢查、精子穿透鏡檢查等。

1、手淫法：手淫法主要是通過自慰的方法使精液達到高度充盈，然后排出體外進行檢查，一般需要禁欲3-5天，所以精子畸形率檢查需要3天左右的時間;

2、顯微鏡檢查：顯微鏡檢查精子畸形率，主要是通過精液當中的細胞形態(tài)觀察精子畸形的情況，需要取精液標本后放入顯微鏡進行觀察，通常需要觀察精子的畸形率，以此判斷精子畸形率的情況，一般需要檢查2-3天即可;

3、精子穿透鏡檢查：精子穿透鏡檢查主要是觀察精子內(nèi)是否存在精子畸形，以及精子核畸形率，需要取男性的精子和女性的卵子在實驗室內(nèi)進行相應操作，所以精子畸形率檢查需要的時間相對較長，一般在3-5天;

4、其他：精漿生化分析可以檢查出精液中是否存在精子DNA碎片，以及精子游動的速度等情況，從而判斷精子畸形率，此時需要的時間相對較長，因為該項目需要取男性的精液標本，所以時間會相對較長。

如果想要檢查精子畸形率，可以在專業(yè)醫(yī)生的指導下進行各項檢查，一旦出現(xiàn)異常情況，建議及時采取針對性治療措施。